Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhodP97348 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhodP97348 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhodP97348 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhodP97348 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhodP97348 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhodP97348 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhodP97348 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhodP97348 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhodP97348 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhodP97348 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhodP97348 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhodP97348 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhodP97348 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhodP97348 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhodP97348 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhodP97348 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhodP97348 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhodP97348 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhodP97348 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhodP97348 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhodP97348 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhodP97348 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhodP97348 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhodP97348 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhodP97348 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhodP97348 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhodP97348 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhodP97348 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhodP97348 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhodP97348 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhodP97348 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RhodP97348 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhodP97348 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhodP97348 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhodP97348 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhodP97348 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhodP97348 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms