Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arf1P84078 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arf1P84078 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms