Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad1P70340 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad1P70340 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad1P70340 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smad1P70340 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad1P70340 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad1P70340 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smad1P70340 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms