Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gfi1P70338 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfi1P70338 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms