Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vamp7P70280 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vamp7P70280 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms