Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkn1P70268 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn1P70268 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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