Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chl1P70232 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chl1P70232 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chl1P70232 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chl1P70232 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Chl1P70232 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chl1P70232 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chl1P70232 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chl1P70232 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chl1P70232 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chl1P70232 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 829.6 ms