Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta1P68134 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Acta1P68134 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Acta1P68134 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms