Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Crabp1P62965 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Crabp1P62965 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Crabp1P62965 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Crabp1P62965 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Crabp1P62965 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Crabp1P62965 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Crabp1P62965 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms