Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps3P62908 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps3P62908 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps3P62908 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3P62908 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3P62908 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps3P62908 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3P62908 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3P62908 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3P62908 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3P62908 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3P62908 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3P62908 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3P62908 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3P62908 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps3P62908 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rps3P62908 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms