Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd1P62315 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snrpd1P62315 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms