Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lsm3P62311 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lsm3P62311 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lsm3P62311 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms