Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmo4P61969 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lmo4P61969 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms