Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga11P61622 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga11P61622 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga11P61622 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms