Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fgf1P61148 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fgf1P61148 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgf1P61148 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgf1P61148 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgf1P61148 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgf1P61148 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgf1P61148 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgf1P61148 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms