Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2d1P61080 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2d1P61080 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms