Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rims4P60191 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms