Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps5P59438 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hps5P59438 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms