Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scarf2P59222 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms