Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps33bP59016 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps33bP59016 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps33bP59016 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms