Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tm6sf1P58749 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tm6sf1P58749 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tm6sf1P58749 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tm6sf1P58749 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tm6sf1P58749 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tm6sf1P58749 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms