Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrpa1P57784 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrpa1P57784 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms