Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtnsP57757 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CtnsP57757 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CtnsP57757 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms