Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FusP56959 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FusP56959 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FusP56959 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FusP56959 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FusP56959 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FusP56959 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FusP56959 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FusP56959 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FusP56959 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FusP56959 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FusP56959 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FusP56959 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FusP56959 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FusP56959 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FusP56959 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FusP56959 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FusP56959 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FusP56959 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FusP56959 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FusP56959 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FusP56959 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FusP56959 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FusP56959 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FusP56959 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FusP56959 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FusP56959 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms