Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn18P56857 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn18P56857 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms