Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SmoP56726 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SmoP56726 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SmoP56726 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SmoP56726 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SmoP56726 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SmoP56726 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SmoP56726 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SmoP56726 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SmoP56726 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SmoP56726 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SmoP56726 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SmoP56726 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SmoP56726 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SmoP56726 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SmoP56726 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SmoP56726 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SmoP56726 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SmoP56726 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SmoP56726 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SmoP56726 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SmoP56726 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SmoP56726 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SmoP56726 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SmoP56726 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SmoP56726 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SmoP56726 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SmoP56726 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SmoP56726 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SmoP56726 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SmoP56726 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SmoP56726 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SmoP56726 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SmoP56726 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SmoP56726 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SmoP56726 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SmoP56726 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SmoP56726 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SmoP56726 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SmoP56726 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SmoP56726 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SmoP56726 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SmoP56726 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SmoP56726 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SmoP56726 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SmoP56726 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SmoP56726 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SmoP56726 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SmoP56726 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SmoP56726 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SmoP56726 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SmoP56726 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SmoP56726 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SmoP56726 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SmoP56726 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SmoP56726 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SmoP56726 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SmoP56726 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SmoP56726 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SmoP56726 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SmoP56726 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SmoP56726 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SmoP56726 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SmoP56726 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SmoP56726 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SmoP56726 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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