Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp2c40P56657 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp2c40P56657 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms