Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CckbrP56481 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckbrP56481 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CckbrP56481 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CckbrP56481 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms