Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1bbP56400 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gp1bbP56400 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gp1bbP56400 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms