Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Usp5P56399 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp5P56399 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp5P56399 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp5P56399 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp5P56399 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp5P56399 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms