Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Abcd3P55096 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abcd3P55096 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms