Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RabggtbP53612 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RabggtbP53612 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtbP53612 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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