Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpaP53566 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CebpaP53566 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CebpaP53566 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CebpaP53566 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms