Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pold1P52431 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pold1P52431 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pold1P52431 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pold1P52431 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pold1P52431 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pold1P52431 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pold1P52431 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pold1P52431 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pold1P52431 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pold1P52431 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pold1P52431 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pold1P52431 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pold1P52431 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms