Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClgnP52194 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ClgnP52194 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ClgnP52194 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ClgnP52194 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ClgnP52194 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms