Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MipP51180 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MipP51180 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MipP51180 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MipP51180 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MipP51180 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MipP51180 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MipP51180 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MipP51180 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MipP51180 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MipP51180 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MipP51180 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MipP51180 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MipP51180 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MipP51180 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MipP51180 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MipP51180 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MipP51180 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MipP51180 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MipP51180 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MipP51180 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MipP51180 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MipP51180 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MipP51180 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MipP51180 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MipP51180 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MipP51180 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MipP51180 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MipP51180 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MipP51180 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MipP51180 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MipP51180 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MipP51180 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MipP51180 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MipP51180 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MipP51180 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MipP51180 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MipP51180 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MipP51180 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MipP51180 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MipP51180 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MipP51180 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MipP51180 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MipP51180 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MipP51180 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MipP51180 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MipP51180 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MipP51180 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MipP51180 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MipP51180 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MipP51180 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MipP51180 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MipP51180 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MipP51180 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MipP51180 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MipP51180 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MipP51180 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MipP51180 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MipP51180 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MipP51180 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MipP51180 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MipP51180 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MipP51180 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MipP51180 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MipP51180 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms