Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Gdi1P50396 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdi1P50396 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdi1P50396 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms