Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtbrP50284 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtbrP50284 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtbrP50284 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtbrP50284 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbrP50284 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtbrP50284 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LtbrP50284 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LtbrP50284 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtbrP50284 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtbrP50284 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtbrP50284 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LtbrP50284 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms