Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cxcl5P50228 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.7 ms