Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc13P50207 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc13P50207 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc13P50207 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms