Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VegfbP49766 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfbP49766 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VegfbP49766 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfbP49766 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfbP49766 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfbP49766 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfbP49766 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfbP49766 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VegfbP49766 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfbP49766 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VegfbP49766 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfbP49766 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfbP49766 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms