Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb42P49222 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb42P49222 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb42P49222 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Epb42P49222 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Epb42P49222 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms