Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbp3P49194 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbp3P49194 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms