Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurod6P48986 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurod6P48986 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms