Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptx3P48759 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptx3P48759 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms