Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrprbP47758 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SrprbP47758 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrprbP47758 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrprbP47758 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrprbP47758 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrprbP47758 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrprbP47758 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms