Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnfrsf4P47741 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfrsf4P47741 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf4P47741 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfrsf4P47741 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms