Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgavP43406 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ItgavP43406 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgavP43406 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgavP43406 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgavP43406 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgavP43406 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms