Protein–RNA interactions for Protein: P43276

Hist1h1b, Histone H1.5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h1bP43276 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hist1h1bP43276 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist1h1bP43276 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms