Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr2f2P43135 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nr2f2P43135 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr2f2P43135 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms